财源枯竭使南京临时政府陷入“巧妇难为无米之炊”的困境，实在无力应对各种艰难的局势。造成南京临时政府财源枯竭的诸多因素主要如下。
一是列强控制海关税收。清政府的海关税收主要用来担保偿还外债和赔款，税款虽然由外籍税务司征收，但其保管和支付则完全由清政府委派的海关道或海关监督负责。武昌起义后，列强便加紧进行攫取中国海关税收控制权的活动。英籍海关总税务司安格联（F.A.Aglen）宣称：“采取某种方针确保关税不致为革命党用作军费，并留供偿还外债，现在已经是时候了。”他主张：“关税暂时由总税务司或领事团保管，如果能商定将税款存入外国银行，应尽先由总税务司保管。”后来，经清政府外务部同意，以英国公使朱尔典为首的外交团决定由上海各外国银行总董组织一个关税管理委员会，规定由海关总税务司将全国各处海关净存税款每星期汇交上海一次，均分收存于汇丰、德华、道胜三家银行，“以作归还该项洋债及赔款之用”，具体由上海税务司按照关税管理委员会决定之先后次序按期偿还各国外债。据此，列强控制了全部海关税收的管理权，以致偿付外债及赔款以外的大量“关余”也被冻结。“此项税款抵还洋债外，为数尚巨，竟听外人掌管，既失权利，复损国体。”时人惟有叹息而已。